U-CH1

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Allgemeine Merkmale

Alter: 56 Jahre
Geschlecht: Männlich
Ursprung der Krankheit: Sakral
Krankheitsstatus: Wiederkehrend
Vorherige Bestrahlung: Ja
Vorherige systemische Therapie: Nein
Quelle: Silke Bruderlein, Peter Moller
Universität Ulm

Molekulare Merkmale

Morphologie der Zellen: Physaliferous
TBXT-Ausprägung: Positiv; 10x mehr als bei U-CH2 mit Überexpression, aber keine Amplifikation
TBXT-Lokalisation: Zellkern
CD24 Ausprägung: Positiv; 13x so hoch wie bei U-CH2
HLA-Typ: A2
Sequenzdaten:

WGS-, Exom- und Transkriptomdaten verfügbar: Rohsequenzierungsdaten in Cavatica (Chordoma Foundation Dataset) und zusammenfassende Daten in PedcBioPortal. Bei Fragen wenden Sie sich bitte an researchteam@chordoma.org.
SMARCB1 Status: Wildtyp
Validierungsergebnisse: Validierungsbericht

Wachstumsbedingungen

Wachstumsmedium: IMDM: RPMI-1640 (4:1) +10% FBS
Gefriermedium: 70% komplettes Wachstumsmedium, ergänzt mit zusätzlich 20% fötalem Rinderserum und 10% DMSO
Kulturbedingungen: Temperatur: 37°C
Atmosphäre: Luft, 95%; Kohlendioxid (CO2), 5%
Anweisungen zur Subkultivierung: Zellkultur-Verfahren

Veröffentlichungen

Charakterisiert durch:
  • Scheil S, Brüderlein S, Liehr T, Starke H, Herms J et al. (2001) Genomweite Analyse von sechzehn Chordomen durch vergleichende genomische Hybridisierung und Zytogenetik der ersten menschlichen Chordom-Zelllinie, U-CH1. Genes Chromosomes Cancer 32: 203-211. PubMed: 11579460.

Zusätzliche Referenzen:

  • Scheipl S, Lohberger B, Rinner B, Froehlich EV, Beham A et al. (2013) Histone deacetylase inhibitors as potential therapeutic approaches for chordoma: an immunohistochemical and functional analysis. J Orthop Res 31(12):1999-2005. PubMed: 23893747.
  • Brüderlein S, Sommer J, Meltzer P, Li S, Osada T et al. (2010) Molecular Characterization of Putative Chordoma Cell Lines. Sarkom: 630129. PubMed: 21253487.
  • Duan Z, Shen J, Yang X, Yang P, Osaka E et al. (2014) Prognostische Bedeutung der miRNA-1 (miR-1) Expression bei Patienten mit Chordomen. J Orthop Res. PubMed: 24501096.
  • Shalaby A, Presneau N, Ye H, Halai D, Berisha F, Idowu B et al. (2011) The role of epidermal growth factor receptor in chordoma pathogenesis: a potential therapeutic target. J Pathol 223(3):336-46. PubMed: 21171079.
  • Scheil-Bertram S, Kappler R, von Baer A, Hartwig E, Sarkar M et al. Molecular profiling of chordoma. Int J Oncol 44(4):1041-55. PubMed: 24452533.
  • Xia M, Huang R, Sakamuru S, Alcorta D, Cho MH et al. (2013) Identification of repurposed small molecule drugs for chordoma therapy. Cancer Biol Ther 14(7):638-47. PubMed: 23792643.
  • Duan Z, Choy E, Nielsen GP, Rosenberg A, Iafrate J et al. (2010) Differential expression of microRNA (miRNA) in chordoma reveals a role for miRNA-1 in Met expression. J Orthop Res 28(6):746-52. PubMed: 20041488.
  • Yang C, Hornicek F, Wood KB, Schwab JH, Choy E et al. (2010) Charakterisierung und Analyse von menschlichen Chordom-Zelllinien. Wirbelsäule 35(13):1257-64. PubMed: 20461036.
  • Presneau N, Shalaby A, Ye H, Pillay N, Halai D, Idowu B et al. (2011) Die Rolle des Transkriptionsfaktors T (Brachyury) in der Pathogenese des sporadischen Chordoms: eine genetische und funktionsbasierte Studie. J Pathol 223(3):327-35. PubMed: 21171078.